Ο ΗΡΑΚΛΗΣ είναι από τα ιστορικότερα αθλητικά σωματεία στην Ελλάδα, με πολυσχιδή δραστηριότητα και Εθνική προσφορά, με πλήθος διακρίσεων σε ομαδικό και ατομικό επίπεδο, με αθλητές που τίμησαν τα Ελληνικά χρώματα, δόξασαν τις αρχές του Συλλόγου και πρόσφεραν σε αγώνες της Πατρίδας. 

Επίσημη ημερομηνία ιδρύσεως, κατόπιν διαδικασιών, ορίστηκε η 29η Νοεμβρίου 1908. 

ΤΟ ΤΜΗΜΑ ΜΠΑΣΚΕΤ

Το τμήμα ανδρικής καλαθοσφαίρισης ιδρύθηκε επισήμως το 1924, αποτελώντας μάλιστα την πρώτη ομάδα που κατέκτησε ποτέ Πανελλήνιο Πρωτάθλημα (1928).
Ο Ηρακλής αγωνίστηκε με τους Σωκράτη Ελευθεριάδη, Γιάννη Αμπατζόγλου, Γιάννη Ιωαννίδη, Γιώργο Περιστάνογλου, Λ.Μπαμπουλουζιάν και Β.Μπενλιάν (στην κεντρική φωτογραφία, η ομάδα το 1927). Επικράτησε με σημαντική διαφορά επί των αντιπάλων καθώς νίκησε τη Νηαρ Ηστ 37-19, την ΑΕΚ 33-6, τον Άρη 30-23 και τον ΒΑΟ στον τελικό με 26-19.
Ο Γιάννης Αμπατζόγλου, που ήταν και ένας από τους παίκτες της ομάδας που κατέκτησε τον πρώτο τίτλο της ιστορίας του Ηρακλή, υπήρξε ένα από τα δεκατρία ιδρυτικά μέλη της παγκόσμιας ομοσπονδίας μπάσκετ FIBA, υπογράφοντας το πρακτικό ίδρυσής της το 1932.

Το 1935 ήρθε ο δεύτερος τίτλος για τον Ηρακλή, καθώς αναδείχθηκε πρωταθλητής Ελλάδος για δεύτερη φορά στη ιστορία του. Επικράτησε επί του Πανιώνιου με 110-40 , του Πανελλήνιου 72-45 και του Πειραϊκό με 2-0 (σ.σ. ο Πειραϊκός δε αγωνίστηκε). Οι μπασκεμπολίστες που έδωσαν το δεύτερο πρωτάθλημα στο τμήμα μας ήταν,οι Γ. Νανές, Γ. Μαντόπουλος, Δ. Καπήλου, Μ. Αδαμίχου, Μ. Παπαγιάννης, Πολυμέρης, Κοκκίνης και Δοσόπουλος.

Σημαντική επίσης είναι η ημερομηνία του 1961 όπου ο Ηρακλής τερμάτισε πρώτος μαζί με Σπόρτινγκ και Παναθηναϊκό αλλά δεν αγωνίστηκε σε μπαράζ αφού έκρινε παράνομη την συμμετοχή του Νάκιου όπου αγωνίζονταν με τον Παναθηναϊκό.

Το 1964 ο Ηρακλής κατακτά τη δεύτερη θέση στο πρωτάθλημα Ελλάδας. Τη χρονιά εκείνη είχε ισοβαθμήσει με την ΑΕΚ (31 βαθμούς, με 13 νίκες και 5 ήττες) αλλά δεν κατάφερέ να φέρει τον 3ο τίτλο σε αγώνα μπαράζ.

ΤΟ ΡΕΚΟΡ ΤΟΥ ΜΟΥΜΟΓΛΟΥ

Τη σεζόν 1971-72 ο καλαθοσφαιριστής του Ηρακλή Αριστείδης Μούμογλου ήταν ο πρωτος σκόρερ της Α εθνικής με 654 πόντους. Στις 13 Ιουλίου του 1972 σημείωσε το ρεκόρ πόντων σε ένα αγώνα που εξακολουθεί να παραμένει ακόμα και στις ημέρες μας. Απέναντι στην ομάδα του ΒΑΟ ο Μούμογλου σκόραρε 145 πόντους σε ένα αγώνα που ο Ηρακλής κέρδισε με 170-94.

Το 1979 η εθνική Ελλάδος κατακτά το χρυσό μετάλλιο στους Μεσογειακούς Αγώνες έχοντας δυο αθλητές του Ηρακλή στη σύνθεση της, τον Τάκη Καρατζουλίδη και το Σωτήρη Σακελλαρίου.

Το 1981 ο Ηρακλής αγωνίστηκε στον τελικό του Κυπέλλου Ελλάδας όμως τροπαιούχος αναδείχθηκε η ΑΕΚ καθώς είχε στη σύνθεσή της τον ομογενή Κερτ Ράμπις.

Το 1987 ολοκληρώθηκε η κατασκευή του Ιβανώφειου κλειστού γυμναστηρίου το οποίο υπήρξε έδρα του συλλόγου. Το 1987 αποκτήθηκε από τον Ηρακλή για τις ευρωπαϊκές υποχρεώσεις ο Ντέιβιντ Ίνγκραμ ο οποίος συμμετείχε από την επόμενη σεζόν και στο πρωτάθλημα. Ο Ίνγκραμ θεωρείτε από τους κορυφαίους παίκτες που έχουν έρθει στην Ελλάδα.

Το 1995 αγωνίζεται στον ημιτελικό του Κυπέλλου Κυπελλούχων Ευρώπης με κορυφαίο τον Γουώλτερ Μπέρι, όμως η ομάδα δεν τα κατάφερε να προκριθεί στον τελικό.

Το 1998 δυο μεγάλοι παίκτες με θητεία στο ΝΒΑ ντύνονται στα κυανόλευκα, ο Εζέβιερ Μακ Ντάνιελ και ο Ρόι Τάρπλει.

Την περίοδο 2000-01 η ομάδα μπάσκετ του Ηρακλή συμμετείχε στη Σουπρολίγκα και προκρίθηκε στις 16 καλύτερες ομάδες της διοργάνωσης. Με τον Ηρακλή αγωνίζονταν εκείνη τη χρονιά ο Δημήτρης Διαμαντίδης, ο Νίκος Χατζηβρέττας, ο Λάζαρος Παπαδόπουλος και ο Σοφοκλής Σχορτσανίτης, που υπήρξαν τέσσερις από τους στυλοβάτες των επιτυχιών της Εθνικής Ελλάδος η οποία τα επόμενα χρόνια αναδείχθηκε πρωταθλήτρια Ευρώπης και δευτεραθλήτρια κόσμου.

Το 2002 ο Νίκος Χατζηβρέττας αναδεικνύεται πρώτος σκόρερ του ελληνικού πρωταθλήματος αγωνιζόμενος με τα χρώματα της ομάδας μας, πρώτος Έλληνας στην ιστορία μετά τον Νίκο Γκάλη.

Τα τελευταία χρόνια ο σύλλογος αγωνίζεται στην Α2 Κατηγορία, με στόχο να επανέλθει στη "φυσική" του θέση, μαζί με τους έτερους μεγάλους συλλόγους του ελληνικού μπάσκετ. 

To 2019 o HΡΑΚΛΗΣ επέστρεψε στην Α1, όπου αγωνίστηκε μέχρι και τη διακοπή του πρωταθλήματος λόγω κορονοϊού, έχοντας καταλάβει μέχρι τότε την 7η θέση του πρωταθλήματος, ενώ μέσω αυτής και της εντυπωσιακής παρουσίας του κόσμου του και της σταθερής διοικητικής του κατάστασης κέρδισε και την επιστροφή του στα Ευρωπαικά Κύπελλα, όπου μετέχει στους προκριματικούς του Basketball Champions League (15/9/2020 το πρώτο ματς).